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IDENTIFICACIÓN DE GENES INVOLUCRADOS EN LA TOLERANCIA DE MORA (RUBUS GLAUCUS BENTH) AL ATAQUE DE COLLETOTRICHUM GLOEOSPORIOIDES USANDO TRANSCRIPTÓMICA DE ALTO PODER (RNA-SEQ).

 

INVESTIGADOR(ES) PRINCIPAL(ES):

NOMBRE
DEDICACIÓN

Martha Leonor Marulanda Angel

20 horas

 

CODIGO CIE

2-11-2

NOMBRE DEL GRUPO DE INVESTIGACIÓN

BIODIVERSIDAD Y BIOTECNOLOGIA

INTEGRANTES DEL PROYECTO

NOMBRE
PARTICIPACION
DEDICACIÓN

Ana María López Gutierrez

Coinvestigador

20 Horas

Juan Manuel López Vásquez

Estudiante

0 Horas

Juliana Arias Villegas

Coinvestigador

20 Horas

 

TIPO DE CONVOCATORIA

2010. Sexta Convocatoria

TIPO DE PROYECTO

Investigación Aplicada

OBJETIVO(S)

Objetivo General Caracterizar el transcriptoma de la interacción entre Colletotrichum gloeosporioides y su hospedero mora de castilla (Rubus glaucus), durante el proceso de infección con el fin de determinar si hay una respuesta diferencial entre accesiones de mora. Objetivos Específicos -Caracterizar accesiones de mora de castilla en condiciones de infestación con aislamientos de Colletotrichum gloeosporioides, para evaluar si hay una respuesta diferencial ante el ataque del hongo. -Caracterizar experimentalmente y por bioinformática la expresión génica de las diferentes accesiones de mora de castilla para determinar cuáles son los posibles genes responsables de la tolerancia y/o susceptibilidad diferencial. -Desarrollar marcadores SSR-EST y/o SNP derivados del análisis de los transcriptomas posiblemente relacionados con una respuesta de tolerancia de R. glaucus ante el ataque de C. gloeosporioides.

RESUMEN

La antracnosis es una enfermedad presente en todas las zonas de cultivo de mora en Colombia con una incidencia entre el 50 y el 73 % y una severidad que en algunos casos puede ser del 100%. Su agente causal Colletotrichum spp., ataca más de 40 géneros de plantas superiores de importancia económica. El control de esta enfermedad ha sido ineficiente a pesar del uso de productos químicos y prácticas culturales. -Evaluar la transferibilidad de los microsatélites obtenidos a partir de C. gloeosporioides en C. acutatum para diferenciar entre ambas especies cuando se encuentren asociadas a la presencia de antracnosis en la mora. Investigaciones realizadas por nuestro grupo en antracnosis de mora causada por Colletotrichum spp han permitido identificar a C. gloeosporioides como el principal agente causal en regiones productoras de mora del departamento de Risaralda, también se ha detectado la posible presencia de un complejo de especies de Colletotrichum asociadas a la antracnosis en algunas plantaciones. Respecto a la respuesta de diferentes accesiones de mora de mora al ataque del patógeno se ha observado una respuesta diferencial de algunos materiales de mora tanto a nivel de pruebas de laboratorio como de observaciones en campo. En esta investigación se espera realizar una caracterización del transcriptoma de la respuesta a nivel molecular de las plantas de Rubus glaucus al ataque de C. gloeosporioides. Finalmente, se seleccionarán plantas que hayan mostrado una respuesta diferencial ante el patógeno en evaluaciones de campo realizadas previamente. Esto permitirá una mejor comprensión del sistema hospedero -patógeno conocido como pato-sistema, el entendimiento de la respuesta diferencial contribuirá a la selección de materiales promisorios para el cultivo de la mora.

ESTADO

Concluido

FECHA DE INICIO

01/01/2011

FECHA DE FINALIZACION

01/01/2013

PRODUCTOS

NOMBRE
CATEGORÍA
ENLACE

Identificación de genotipos promisorios de mora (Rubus Glacus Benth Resistentes a la Antracnosis causada por Glomerella Cingulata (Stoneman) Spauld & H.Scherenk

Trabajo de grado de maestría